Для того, чтобы растянуть рабочий стол на два экрана (или на большее число экранов) нужно:
Открыть файл графических настроек сессии пользователя, расположенный в его домашнем каталоге (обычно .fly/theme/current.themerc);
Найти в нём закомментированные строчки
#FlyDesktopY=0
#FlyDesktopWidth=0
#FlyDesktopHeight=0
Раскомментировать эти строчки, и указать в них нужное положение экрана.
Положение задаётся в пикселях, как сумма разрешения мониторов. Например, для двух мониторов 1920x1080, расположенных рядом это будет
FlyDesktopY=0
FlyDesktopWidth=3840
FlyDesktopHeight=1080
А для двух мониторов 1920x1080, расположенных "по вертикали" это будет
FlyDesktopY=0
FlyDesktopWidth=1920
FlyDesktopHeight=2160
Сохранить сделанные изменения, и, если пользовательская сессия запущена, перезапустить её.